O objetivo do INCT-TB é contribuir para o controle e tratamento de TB.  Isso está sendo executado por meio de três principais linhas de frente:
1. Identificação de compostos líderes com base em alvos definidos
2. Desenvolvimento racional de vacinas
3. Desenvolvimento e validação de novos métodos de diagnóstico de TB suscetível e resistente a fármacos e novos genótipos emergentes

 A proposta do INCT-TB é inovadora porque contempla uma abordagem focada no desenvolvimento de compostos químicos ativos contra alvos validados de M. tuberculosis, uma abordagem racional de novas vacinas e de novos testes fenotípicos e moleculares para prevenir TB e detectar o bacilo, respectivamente. A maior expectativa do INCT-TB é desenvolver efetivamente um agente anti-TB, uma vacina eficiente, e um teste diagnóstico molecular para controlar a TB com uma abordagem "da bancada à prateleira".